Винда на КПК не "переустанавливается" как на обычных компьютерах. Удалить программу можно, скажем, потерев директорию с ней. Полная очистка КПК от установленных программ и данных производится с помощью хард ресета. Посмотри в документации, как это делается. Предупреждаю, что хард ресет оставит на твоем КПК только(!) винду, и программы, которые прошиты в памяти.
Что значит "диск толком читаться не хочет"? Проясните пожалуйста.