Читать всем!!!

 
1 2 3 4 5

Tais

администратор

stas27, 03.04.2004 04:51:01 :
Вторая картинка:
 


По данным наших клиницистов, по частоте заболеваемости на первом месте - рак легких у мужчин, и рак молочной железы у женщин. А здесь на картинке рак предстательной железы. Это где, в шатах?
 

Tais

администратор

stas27, 04.04.2004 10:20:39 :
Что делается не так:
1. Подход к проблеме принципиально неверный. Главная идея нынушнего подхода - надо полностью понять механизм возниковения рака, только после этого можно рассчитывать на улучшение дел в больнице.
 


В РОНЦ им. Н.Н. Блохина подоход к проблеме рака системный: НИИ Канцерогенеза изучает механизм, НИИ ЭДиТО - разрабока и доклиническое изучение препаратов, клиника - клиническое изучение.

>2. Неправильная организация финансирования.

Согласна.

>3. Неправильная оценка труда учёных.

Согласна.

>5. Неправильная законодательная база для допуска лекарств. Единственный (фактически) критерий – способность уменьшать размер опухоли, который очень слабо коррелирует с прогнозом и выживаемостью.

При скрининге лекраственных средств in vivo учитываю ТРО(%) - торможение роста опухоли и среднюю продолжительность жизни.


Вот ссылки по теме
0103_012.pdf

9605_004.pdf

9710_085.pdf

0110_018.pdf

9812_012.pdf

9801_016.pdf

9809_008.pdf

0008_033.pdf
 
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Tais, 16.05.2004 15:15:07 :
stas27, 03.04.2004 04:51:01 :
Вторая картинка:
 


По данным наших клиницистов, по частоте заболеваемости на первом месте - рак легких у мужчин, и рак молочной железы у женщин. А здесь на картинке рак предстательной железы. Это где, в шатах?
 


Да, в Штатах. Заболеваемость раком лёгких сильно снизилась (т.к. многие бросили курить). С раком простаты вообще-то ситуация довольно сложная. В 90х был "скачок" - в 2 раза увеличилось количество зарегистрированных случаев. Связано было с началом массового скрининга ПСА. По-моему, такого массированного скринирования нигде в мире нет. Или я ошибаюсь? В любом случае, в Европе судя по статистике заболеваемость раком простаты гораздо ниже. Но зато гораздо легче найти образцы "продвинутых" опухолей (advanced stage).
С уважением, Стас.  
Это сообщение редактировалось 16.05.2004 в 18:42
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Tais, 16.05.2004 15:52:56 :
stas27, 04.04.2004 10:20:39 :
Что делается не так:...
 


При скрининге лекраственных средств in vivo учитываю ТРО(%) - торможение роста опухоли и среднюю продолжительность жизни.


Вот ссылки по теме
0103_012.pdf

9605_004.pdf

9710_085.pdf

0110_018.pdf

9812_012.pdf

9801_016.pdf

9809_008.pdf

0008_033.pdf
 


Вот это (жирным шрифтом) - здорово! За ссылки спасибо - приеду домой, почитаю!

Кстати, Вы не знаете, есть ли в России коллекции образцов метастазов? Особенно интересуют рак груди и простаты. А если бы они были ещё и свежезамороженными :wub: ... А если бы к ним были ещё образцы первичных опухолей из того же пациента... :wub: :wub: :wub: Очень трудно найти такие образцы здесь - программу "тёплой аутопсии" (warm autopsy) мы смогли найти только в Гарварде, и у них всего 25 образцов простатных метастазов. Если есть какая-нибудь информация, пишите мылом (линк в моём профиле). Может быть, удастся посотрудничать...
С уважением, Стас.  

Tais

администратор

stas27, 16.05.2004 18:51:46 :
Кстати, Вы не знаете, есть ли в России коллекции образцов метастазов? Особенно интересуют рак груди и простаты.
 


На счет коллекции метастазов я на в курсе. На сколько мне известно, у нас лаборатории НИИ работают по договоренности с больницей, откуда им поставляют свежевыделенный материал больных. Постараюсь узнать поточнее. У нас существует банк замороженных штаммов опухолей человека и животных (мышей, крыс, хомячков, кроликов)

> А если бы они были ещё и свежезамороженными :wub: ...

В нашей лаборатории в данный момент на бестимусных животных ведется штамм PC3 - рак предстательной железы человека, который метастазирует в костный мозг, лимфоузлы и легкие.
 
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Tais, 16.05.2004 18:58:37 :
stas27, 16.05.2004 18:51:46 :
Кстати, Вы не знаете, есть ли в России коллекции образцов метастазов? Особенно интересуют рак груди и простаты.
 


На счет коллекции метастазов я на в курсе. На сколько мне известно, у нас лаборатории НИИ работают по договоренности с больницей, откуда им поставляют свежевыделенный материал больных. Постараюсь узнать поточнее. У нас существует банк замороженных штаммов опухолей человека и животных (мышей, крыс, хомячков, кроликов)

> А если бы они были ещё и свежезамороженными :wub: ...

В нашей лаборатории в данный момент на бестимусных животных ведется штамм PC3 - рак предстательной железы человека, который метастазирует в костный мозг, лимфоузлы и легкие.
 


Если удастся что-то узнать, то будет здорово! Но PC3 и иже с ними не годятся - уж очень много различий между ними и первичными опухолями. Убедить кого-то в том, что с такими простатными линиями работать стоит практически невозможно. Конечно, ПМСМ, обобщения типа "Простатные клеточные линии ни на что не годятся" не слишком правильны, всё зависит от того, как и какой вопрос ставить. Но реальность остаётся - один и тот же наш грант был отфуболен, когда в качестве объекта мы собирались использовать PC3 и прошёл на ура, когда обещали использовать клинический образец...

Замороженные образцы человека всегда интересны. Особенно, если есть подробная клиническая история.

Если не секрет, Вы чем занимаетесь?

С уважением, Стас.  

Tais

администратор

Изучаю действие индукторов дифференцировки (политрансретиноевой кислоты, интерлейкина-2, альфа-интерферона, дикарбамина, миелопептида 4) в сочетании с цитостатиками на различных моделях опухолей. Пока экспериментирую на эритробластозе Френд.

Какова цель Вашей работы? :)
 
06.07.2004 19:44, Zeus: +1: Ого! Засугг... заак... в общем, за!

US Зверь #19.05.2004 18:08
+
-
edit
 

Зверь

опытный

stas27, 15.05.2004 23:28:32 :
А определение, что такое "раковая клетка", дадите?
 


Легко: раковые клетки -клетки способные к неограниченому делению. (Стволовые клетки при делении дают одну стволовую и одну не стволовую с ограниченым колличеством делений)
Ибо те же самые клетки после добавления BCL2 (т.е. изменения 2 генов) успешно разможались и давали вполне такие классические опухоли, включая васкуляризацию. А после устранения МИКа со сцены вполне такая себе васкуляризованная опухоль рассасывалась. Сама по себе, примерно за неделю. Эти клетки были раковыми, или нет?
 
Первое Да, второе НЕТ.
Возвращаясь к моему примеру, он, на самом деле, весьма корректен.
 
Как об стенку горохом.
Ибо скорость размножения раковых клеток (если её измерять как увеличение числа клеток в единицу времени) обычно регулируется за счёт увеличения числа выживающих клеток, а не за счёт изменения скорости митоза или там G- S-фазы. Что можно видеть, хотя бы на примере даже такой в дупель раковой линии как HeLa. В культуре.
 
Селекция подразумевает селективное преимушество.Доходит? Нет? Это вовсе не означает, что изменения должны произойти, но если они произойдут то клетки с данными изменениями получат преимушество в данной системе, поскольку условия на чашке отличаються от условий в организме. Напоследок не скажите почему люди делают сток той же HeLa и на каждый новый эксперемент размораживают клетки заново.
 
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Tais, 16.05.2004 21:31:03 :
Изучаю действие индукторов дифференцировки (политрансретиноевой кислоты, интерлейкина-2, альфа-интерферона, дикарбамина, миелопептида 4) в сочетании с цитостатиками на различных моделях опухолей. Пока экспериментирую на эритробластозе Френд.

Какова цель Вашей работы? :)
 


Пытаемся понять, как можно наиболее эффективно определять структуру ракового генома (или раковых геномов, чтобы Зверя кондрашка не хватила :) ). Общепринятые методы позволяют получить либо общую структуру генома (цитогенетически), что не даёт обычно ни малейшего представления о том, какова последовательность ДНК в районах перестроек, и какие там находятся гены. Либо можно получить информацию о копийности тех или районов ракового генома, с любым уровнем разрешения (вплоть до сиквенса), но при этом абсолютно ничего неизвестно относительно общей организации генома (т.е. какие в нём есть транслокации, инверсии и пр. структурные изменения).

Ну вот мы и разработали метод, который позволяет быстро получать и всесторонне характеризовать геном раковой клетки, и при этом клонировать все брейкпойнты. Так что теперь исследуем так одну опухоль за другой ;) .

Плюс к этом занимаемся также тем, что пытаемся понять, можно ли создать практически ценную систему клинической классификации опухолей на основе информации об их геноме. При этом этот наш новый метод не используется (дорог он, как и всё хорошее :) ), так что приходится использовать только "профиль копийности". Вроде бы что-то на раке простаты получается, поэтому сейчас мы и ищем коллекции образцов, чтобы проверить сию методу.

З.Ы. Простите за косноязычие - трудно о работе писать по-русски :unsure:
С уважением, Стас.  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
stas27, 15.05.2004 23:28:32 :
А определение, что такое "раковая клетка", дадите?
 


Легко: раковые клетки -клетки способные к неограниченому делению. (Стволовые клетки при делении дают одну стволовую и одну не стволовую с ограниченым колличеством делений)
 


Чудесно. Очень приятно наконец-то получить хоть одно определение ;) .

Ибо те же самые клетки после добавления BCL2 (т.е. изменения 2 генов) успешно разможались и давали вполне такие классические опухоли, включая васкуляризацию. А после устранения МИКа со сцены вполне такая себе васкуляризованная опухоль рассасывалась. Сама по себе, примерно за неделю. Эти клетки были раковыми, или нет?
 
Первое Да, второе НЕТ.
 


Что "ПЕРВОЕ", а что "ВТОРОЕ"? :blink: Повторяю вопрос. Переформулируя его, на случай если Вы его не поняли. Имеем: нормальные клетки островков Лангерганса, в которых экспрессируется МИК под индуцируемым промотором и БЦЛ-2 (может быть, тоже под индуцируемым промотором). Пока промотор работает (в организме есть индуцируещее его соединение), клетки способны к неограниченному делению и формируют классические опухоли. Гистологически неотличимые от опухолей, полученных другими способами. Убираем индуктор, опухоль рассасывается. Клетки опухолей были раковыми или нет?

Возвращаясь к моему примеру, он, на самом деле, весьма корректен.
 
Как об стенку горохом.
 


Ну, что что Вы умеете (любите?) хамить собеседникам, мы уже знаем. Вполне можно лишний раз это не демонстрировать.

Ибо скорость размножения раковых клеток (если её измерять как увеличение числа клеток в единицу времени) обычно регулируется за счёт увеличения числа выживающих клеток, а не за счёт изменения скорости митоза или там G- S-фазы. Что можно видеть, хотя бы на примере даже такой в дупель раковой линии как HeLa. В культуре.
 
Селекция подразумевает селективное преимушество.Доходит? Нет? Это вовсе не означает, что изменения должны произойти, но если они произойдут то клетки с данными изменениями получат преимушество в данной системе, поскольку условия на чашке отличаються от условий в организме. Напоследок не скажите почему люди делают сток той же HeLa и на каждый новый эксперемент размораживают клетки заново.
 


Вижу страстную тираду. Опять вижу грубость. Не вижу логической связи между Вашими и моими словами. Вербализуйте свои представления повнятнее, пожалуйста.

В Н+1 раз: примеры работ, показывающих селективное преимущество "быстро размножающихся" раковых клеток перед менее быстро размножающимися товарками - в студию. Определение "скорости размножения" клеток - в студию. Внятное описание преимуществ "быстрого размножения" перед выживанием - в студию.
С уважением, Стас.  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Ещё немножко интересной статистики:

- из 71 лекарства, одобренного для лечения рака в США с 1990 г. три четверти одобрены НЕ для продления жизни больных.

- расходы на лечение одного ракового больного в Штатах составляют 50-120 килоуев.

- ежегодно на лечение больных раком расходуется порядка 61 миллиарда долларов. Поскольку эта величина растёт, ожидается, что за следующие 10 лет будет потрачено около 800 гигауев.

- население США потребляет в среднем на 225 фунтов в год больше еды, чем в 1990 г (на человека).

- потребление красного вина способно заметно снизить риск заболевания раком простаты. Общий уровень потребления алкоголя рояли не играет, водка, пиво и белое вино влияния на заболеваемость раком простаты не оказывают.

Цифры и фактики из докладов и постеров на последней конференции Prostate Cancer Foundation. Будет время - ещё несколько фактиков кину...
С уважением, Стас.  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Вроде бы начали всерьёз разговаривать о проекте "Геном Рака"... Правда, пока то, что заявляют как одну из целей данного проекта (см. жирный шрифт) имеет не много смысла и вряд ли выполнимо. Ссылаются на какую-то 25 страничную "Белую Бумагу" :D, поданную в Национальный Институт Рака, но найти её там я не смог... Но, в любом случае, т. Лэндер славится умением выбивать БАБКИ, пудря людям мозги. ;) .

NATIONAL INSTITUTES OF HEALTH:NCI Gears Up for Cancer Genome Project
Jocelyn Kaiser
The National Cancer Institute (NCI) is hoping to launch a $1.5 billion effort to identify all major mutations in the most common human cancers. The 10-year project would gather tumor samples from thousands of patients and scrutinize them for genetic glitches. "If we can sequence the cancer genome, ... I think we must," says Anna Barker, NCI deputy director for strategic scientific initiatives. …

Science, Vol 307, Issue 5713, 1182 , 25 February 2005.

....

A Cancer Genome Project?
An expert panel offering biotechnology advice to National Cancer Institute (NCI) Director Andrew von Eschenbach expects to propose an ambitious new project that would identify all major cancer genes. The task force, led by Eric Lander of the Broad Institute in Cambridge,Massachusetts, and Lee Hartwell of the Fred Hutchinson Cancer Research Center in Seattle,Washington, gathered advice from about 50 scientists who met in focus groups from March to June.
Last week, Lander told the National Cancer Advisory Board (NCAB) that the group’s draft plan includes a “Human Cancer Genome Project” that would analyze tissue samples to compile a database of all genes that are mutated in at least 5% of major cancers.“It is a finite problem,” he said.
A second project would pose specific challenges in detection, such as using nipple fluid to detect breast cancer.The panel also wants NCI to set up a permanent technology panel that would produce “actionable” items with timelines and budgets, Lander said.
He expects to present the full report at NCAB’s December meeting. Finding money for new initiatives could be difficult. But NCAB Chair John Niederhuber, an oncologist at the University of Wisconsin,Madison, says that by presenting Congress with a “business plan,”NCI “might be able to tell a very powerful story.”
–JOCELYN KAISER

Science, Vol 305, Issue 5692, 1885 , 24 September 2004
 
С уважением, Стас.  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Так, начали раскручивать пропаганду ( The New York Times > Health > Huge Genome Project Is Proposed to Fight Cancer ) :

The work would cost nearly $1 million per tumor sample today, or a total of about $12.5 billion, according to the committee's proposal. The estimated cost of $1.35 billion is based on an expectation that sequencing costs will decline to one-tenth of what they are now in the next few years.
 


О как! Однако, ответа на главный вопрос до сих пор нет: КАК именно они собираются секвенировать активные гены в раке. Если стандартными методами, то на анализ одной опухоли нужно потратить сотни микрограмм ДНК (опухолевой). Что совершенно нереально. Поскольку сам д-р Лэндер, затевающий это совсем не дурак, знать это он должен. Но молчит как таракан...

Посмотрим...
С уважением, Стас.  

Fakir

BlueSkyDreamer
★★★★☆
- из 71 лекарства, одобренного для лечения рака в США с 1990 г. три четверти одобрены НЕ для продления жизни больных.
 


А для чего же, собственно? :blink:

 
RU вантох #18.08.2005 23:23  @Fakir#18.08.2005 22:23
+
-
edit
 

вантох

опытный

Fakir>
- из 71 лекарства, одобренного для лечения рака в США с 1990 г. три четверти одобрены НЕ для продления жизни больных.
 

Fakir> А для чего же, собственно? :blink: [»]
Для повышения качества жизни онкобольных - анальгетики, антиэметики итп.

Это просто в нынешних условиях такие методы не применяются, но вообще они есть.  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
А куда же делся мой сегодняшний пост? С ПДФкой интересной?
С уважением, Стас.  

stas27

эксперт
★★☆
stas27> А куда же делся мой сегодняшний пост? С ПДФкой интересной? [»]

Ну делся так делся... Вот опять ПДФка (посмотрим, может быть, в этот раз пост выживет :rolleyes: ).

Наконец-то у т. Габора Миклоша хватило смелости сказать, что не всё ладно в королевстве датском, и что вряд ли имеет смысл тратить 12 гигауев на проект, научная ценность которого, мягко говоря, не очевидна. Хм, похоже, что Австралия становится землёй вольнодумцев... :)
Прикреплённые файлы:
 
С уважением, Стас.  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Вышло-таки несколько RFA для пилотных проектов по программе "Геном Рака". Вот один:
NCI Sets Aside $35M to Create Cancer Genome Characterization Network Under TCGA Project
By a GenomeWeb staff reporter

NEW YORK, March 13 (GenomeWeb News) - The National Cancer Institute has set aside $35 million in funding over the next three years to create a network of Cancer Genome Characterization Centers, or CGCCs, which will "generate diverse and complementary datasets and develop bioinformatics tools that support a rational approach for the selection of candidate genes and genomic regions for sequencing," according to NCI's request for applications.



The CGCC network is a component of The Cancer Genome Atlas (TCGA) Pilot Project that NCI and the National Human Genome Research Institute announced in December.



According to the RFA, the TCGA's centralized Human Cancer Biospecimen Core Resource will provide each CGCC with biomolecules obtained from highly annotated, quality-controlled human cancer biospecimens. The CGCCs are expected to use techniques that maximize genome coverage and resolution to provide optimal information on the cancer genome, epigenome, and transcriptome.



"Each CGCC team will be expected to have achieved the operational capacity to conduct analyses at a minimum rate of 1,000 samples per year by the end of the first six months," the NCI RFA states. "It is anticipated that throughout the project each group will implement protocols that further enhance sample throughput capabilities, allowing throughput rates to exceed 1,000 samples each year in years 2 and 3 of the Pilot Project."



NCI said it intends to commit approximately $35 million for three years to fund up to four centers, with around $11.7 million allotted for 2006.



Letters of intent from interested parties are due April 12 and applications are due May 12.



The complete announcement is available here.
http://grants.nih.gov/grants/guide/rfa-files/RFA-CA-07-014.html
 


Вкратце - предлагается посоревноваться за 35 мегауев, организуя Центры Характеризации Ракового Генома. ЕМНИП (надо бы проверить по ссылке, но времени нет) конкурсанты должны выбрать 2 (и только 2) технологии, которые позволят им через 6 мес после начала финансирования выйти на производительность по характеризации выбранным методом 1000 образцов опухолей в год.

В рамках же этой программы продлили RFA (Request For Applications) по применению новых технологий для характеризации опухолей. ПДФка приложена.
С уважением, Стас.  
RU вантох #24.04.2006 16:21
+
-
edit
 

вантох

опытный

Вышло-таки несколько RFA для пилотных проектов по программе "Геном Рака".
 

Хм. А разве раковый геном стабилен?
Это просто в нынешних условиях такие методы не применяются, но вообще они есть.  

kexxx

втянувшийся
ее?? йа несовсем проследил мысль - следует ли из того что проблемы с сосудами почти гарант что не будет проблем с раком ??или по крайне мере значительно риск снижен ??
sovki must die  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Хм. А разве раковый геном стабилен?
 


Нет, конечно. Но знать какими они бывают, ПМСМ, надо. См. историю с тем же Гливеком (он же STI-571)
С уважением, Стас.  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
ее?? йа несовсем проследил мысль - следует ли из того что проблемы с сосудами почти гарант что не будет проблем с раком ??или по крайне мере значительно риск снижен ??
 


Честно говоря, не понял вопроса. О связи "проблем с сосудами" и рака я не знаю ничего. Разве что, можно предположить, что проблемы с сосудами не дадут вам "дожить до вашего рака" ( по мотивам лекций ак. Е.Д. Свердлова) ;)
С уважением, Стас.  
+
-
edit
 

stas27

эксперт
★★☆
Официальная пропаганда, объясняющая, почему нет ничего важнее точечных мутаций в раковых геномах (немножко утрируя ;) ). И пропавший ответ на неё от венгерского вольнодумца в Австралии :) . ПДФки приложены (опять...)
 
С уважением, Стас.  

dimir

втянувшийся
☆★
В естественных условиях из многих сотен известных болезней лишь 8-10 служат причиной смерти каждых 85 человек из 100 в пожилом возрасте. Эти болезни возникают обязательно, как бы по определенному плану, начертанному механизмом развития.
Вот главные из них:
ожирение, сахарный диабет тучных, гипертоническая болезнь, метаболическая иммунодепрессия, атеросклероз, аутоиммунные болезни, психическая депрессия и рак.

Поэтому без решения проблемы старения вообще лекарства от этих болезней, и рака в том числе, найти невозможно.
Ещё не вечер!  

dimir

втянувшийся
☆★
Взял отсюда.
В.М.Дильман. Большие биологические часы (введение в интегральную медицину)
Ещё не вечер!  
1 2 3 4 5

в начало страницы | новое
 
Поиск
Настройки
Твиттер сайта
Статистика
Рейтинг@Mail.ru