KonungR> Встречал и слово "перестройка" - потому что в ряде случаев менялись обводы корпуса (носовой части), или ограждение рубки, делались врезки, ставились новые дизеля. Видимо, поэтому... Понятно.
Если меняется назначение корабля, то переоборудование.
А перестроить корабль могут и без изменения предназначения.