Balancer> Гы. Если при Drag-n-drop навести объект на приложение в таскбаре и задержать, то окно приложения не всплывает. При стандартном drag-n-drop'е и всплывает всё, и активным становится, и вообще работает как надо. Либо Вы что-то не так делаете, либо у конкретной софтины сильно кастомный drag-n-drop приготовленный кривыми руками.
*Internet Explorer 9, кстати, как раз и есть пример такой софтины
Таскание таба взаимодействует с таскбаром очень нездорово...
Учитесь читать.